کانال ۱۴ اسرائیل گزارش داد که مقام‌های آمریکایی بر این باورند که تاسیسات هسته‌ای مخفی دیگری در ایران وجود دارد که در فهرست اهداف حمله قرار نگرفته بودند و همچنان به فعالیت خود ادامه می‌دهند.
سی‌ان‌ان نیز در گزارشی بر اساس ارزیابی اولیه‌ای که سازمان اطلاعات دفاعی آمریکا انجام داده، نوشت حملات آمریکا به تاسیسات هسته‌ای ایران که پس از عملیات اولیه اسرائیل انجام شدند، با استفاده از بمب‌افکن‌های بی۲ و بمب‌های سنگرشکن علیه تاسیسات غنی‌سازی در فردو و نطنز صورت گرفتند. با این حال، به‌نظر می‌رسد که آسیب وارده عمدتا به زیرساخت‌های روی زمین مانند تاسیسات برق و تبدیل اورانیوم وارد شده، نه به اجزای اصلی که در عمق زمین قرار دارند.
تاسیسات اصفهان، که به‌عنوان مهم‌ترین مرکز تحقیقاتی هسته‌ای ایران شناخته می‌شود، با موشک‌های تاماهاوک شلیک‌شده از یک زیردریایی مورد هدف قرار گرفت. به گفته یک منبع، این تصمیم بر اساس این ارزیابی گرفته شد که بمب‌های سنگین توانایی نفوذ به عمق محل قرارگیری این تاسیسات را ندارند.
